У Канцеларији за сарадњу у оквиру економске интеграције на подручју Западног Балкана обављају се стручни и административно-технички послови који се односе на координацију рада органа државне управе и остваривање сарадње Републике Србије у оквиру економске интеграције на подручју Западног Балкана; стручни послови подршке Влади и Кабинету председника Владе, изузев оних које обављају други сектори; послови координације рада државних органа у међуресорним пројектима од значаја за Републику Србију за које није одређена надлежност органа државне управе, као и послови подршке регионалним и међународним пројектима у којима учествује Република Србија за које није одређена надлежност органа државне управе; учешће у процесима који су у вези са стручним усавршавањем државних службеника у Канцеларији и други послови из делокруга Канцеларије.
У саставу Канцеларије за сарадњу у оквиру економске интеграције на подручју Западног Балкана образују се уже унутрашње јединице:
- Група за послове у оквиру економске интеграције на подручју Западног Балкана;
- Група за пројекте од значаја.